Immunhisztokémiai vizsgálatokat általában egyes sejtalkotók (pl. receptorok, sejtfelületi antigének) antigénjeinek, esetleg kórokozók kimutatására veszünk igénybe. Az immunhisztokémia a rutin kórszövettani vizsgálatnál sok esetben jóval több információt szolgáltató, a modern patológiai diagnosztikában immár nélkülözhetetlen módszer. Egyes neoplasiák esetében csupán IH vizsgálattal adható korrekt diagnózis. A lymphomás betegekből származó minták immunhisztokémiai vizsgálata segít behatárolni a proliferálódó sejtek eredetét, ami prognosztikai jelentőséggel bír, és a kemoterápiás protokoll megválasztásához is nélkülözhetetlen. De használatos ez a vizsgálat metasztázis-keresés esetében v. kórokozó antigén kimutatására is. Ha a rutin kórszövettani vizsgálat során immunhisztokémiai vizsgálat szükségessége merül fel, a vizsgálatot csak a beküldő állatorvos / tulajdonos beleegyezése és költségvállalása után végezzük el.